Głównym celem Wielkopolskiego Atlasu Ornitologicznego jest koordynacja i ukierunkowanie działań obserwatorów ptaków. Jest to program badawczy, który ma umożliwić uzyskanie aktualnych danych o rozmieszczeniu i częstości występowania wszystkich gatunków ptaków lęgowych w Wielkopolsce.
Ponadto, projekt posłuży do: